Yamaha电单车除了推陈出新之外，亦不忘融入百家创意。于是厂方在2013年起就在世界各地，找来顶级的工匠，为数个Sport Heritage型号进行改装。既要改头换面之余，亦要保留原车的神韵。在数个型号之中，XJR1300可说是最多Yard Built特别版的一员。
由2013年起，Yard Built XJR1300就已经有Monkeefist、Project X、Rhapsody in Blue、Skullmonkee及最新的Dissident版本。
Monkeefist
第一台Yard Built改装版的XJR1300是来自丹麦的改装公司Wrenchmonkees的。而对於Wrenchmonkees来说，XJR1300并不是他们首台改装的Yamaha电单车，他们之前已有改装SR500及XS650的经验。
Monkeefist的改装方向，就是将XJR1300化身成为cafe racer。Monkeefist有趣的地方在於Wrenchmonkees特制了一系列改装套件，车主可以整套装上XJR1200或XJR1300，使XJR变为cafe racer。Wrenchmonkees的负责人Per Nielsen表示，他们的工作只是启发车主为爱驹改装，他们设计的只是原型，而改装套件就是将他们部份的设计意念转化为市售产品。然而这些换上改装套件，车身仍可以保留原有的油缸、车架、摇臂。即是车主可以不用进行大改，亦可以为爱驹带来另一种感觉。而对於较少改装经验的车主来说，他们也可以在车房内DIY改装了。
Project X
2013年的另一个Yard Built计划就落在意大利Deus Ex Machina手上，他们为这款Yard Built XJR1300取名Project X。在接触XJR1300之时，负责人Alessandro Rossi就有以下的疑问：「到底这台肌肉型的电单车之下藏着了甚麽？」於是他们从70至80年代一些传奇耐力赛战马取得灵感：「那些纤巧的线条只有一个目的 – 就是要争胜！所以我们决定为XJR1300减磅，制造一台挖空的XJR，将那台1251cc的水冷心脏展示出来，摆出一副战斗格。」
改装的重点在於拆走车身的侧盖及行街使用的部件，之後换上更阔的把手，再为车身换上经人手打造的铝合金部件。车身用上名为「透明黑」的特别油漆，那是一种非啡非黑的颜色，而是一种深啡黑的颜色，同时透明的特质又让底下的铝合金反射出来。
除了偷轻之外，向昔日的耐力赛战马致敬也是改装重点。所以Project X就换上了高阶的Ohlins避震、Brembo放射式卡钳及离合器拉杆，再配上LeoVince钛合金尾喉、Pirelli轮胎及Marvic Streamline镁合金轮圈。虽然Ohlins的金色前叉加黄色的尾避震弹簧是大家梦寐以求的东西，但跟改装方向不太合拍，於是改装公司就将前叉镀黑，还有将避震弹簧用粉末涂层染黑。最後，整架车出来就是一台街头霸王的形态。
来到命名的部份，负责人表示：「Yamaha希望我们秘密地进行改装计划，所以改名时就只有一个名字合衬：Projet X。」
Rhapsody in Blue
Rhapsody in Blue是2014年的出品，由位於纽约市的日籍电单车制作技师Keinosuke (Keino) Sasaki打造而成。Keino为XJR亲手打造了更低更纤巧的油缸，亦用手工打造了新的鸭尾。更有趣的是他为车头换上他的招牌弹簧前叉。车身同时还有改装的卡钳码、新头灯组及把手等。制动换上强化的Brembo，风隔改为外露式。车尾副架经过重新制作，而座鞍就改为单座。车尾的线条变得更运动化，而尾避震的用色亦呼应了前叉设计。小巧的尾灯，其实来自复古的英国MG四轮跑车。排气改为侧置式，带来经典的复古韵味。车身用上经典的Yamaha蓝色，再配以金色轮圈。
Keino的设计意念来自九十年代日本经典的直四超级街车。简约的车尾、原始的设计，成为了Rhapsody in Blue的基础。
Skullmonkee
踏入2015年，Yard Built的XJR也自然用上全新的XJR1300，今回再次找来位於哥本哈根的Wrenchmonkee，再一次打造上几口螺丝就可以完成的改装。Yamaha Motor Europe产品经理Shun Miyazawa表示：「他们的XJR1300 Monkeefist可说是2015新款XJR之父。那个改装的款式为我们带来创作灵感。它的影响让我们明白到不用为车身带来激烈的改造，只要集中於微调及升级，就可以改善整台车。」
Wrenchmonkee的Per Nielsen表示：「我们尽力确保没有激进的设计，反而会集中於投入简洁的设计与剪影，并且对车身没有任何切割或焊接。」Wrenchmonkee的另一伙伴Nicholas Bech表示：「我们希望从车身拆去一些部件，令人觉得它从来未存在过。之後我们亦开始从其他品牌之中找寻合适的加装件，再将它改装成我们的风格。」
於是Skullmonkee的车身变得简洁之余亦用上不少改装部件，例如LSL Speed Match黑色铝合金軑杆，配以Biltwell手胶。中央换上小巧的MMB电子仪表。头灯是Wrenchmonkee独家打造的黄灯。制动用上全配Beringer产品，包括了Hypersport制动碟、Beringer前後卡钳、手泵以及Beringer的离合器手泵。脚踏是LSL的哑黑铝合金制品，但经WM改造後就让骑士有更激进的坐姿。尾避震是Ohlins的STX36。轮圈沿用XJR的，但就换上Michelin Pilot Road 4S轮胎。车头还有LSL Titan转向钉把。车尾改用LED灯，车身还有改装的4出2不锈钢尾喉。
Dissident
Dissident是最新鲜出炉的Yard Built XJR，今次就由葡萄牙的改装公司it RoCkS!bikes操刀。今次的设计意念之一，就是要庆祝XJR诞生20周年。然而起用葡萄牙改装公司，当初也是一场赌博。不过最终的制成品却是让人心悦诚服的。Yamaha Motor Europe产品经理Shun Miyazawa表示：「It RoCkS!bikes是我们想合作的改装公司首选之一，他们改装1200及1300型号的经验，让我们可知他们可以制作出色的改装车而不会失去原有的特质。」
一如所有的Yard Built型号，改装的最基本条件就是对车身不作任何切割或焊接，并展示出「plug & play」的改装可以令XJR1300有多大的变化。负责人Osvaldo及Alexandre於日间其实是土木工程师，而他们的设计风格也很容易辨认。所有的改装车都用上一体式的油缸，即是油缸至座鞍/鸭尾都是一件过的。这样的设计就需要讲求精准，同时亦要注重细节。在Dissident身上，这件由人手打造的金属部件，由上下眼镜的後方，一直伸延至车尾并将LED尾灯隐藏。车头的避震改用了YZF-R1的倒叉。把手末端的指挥灯由Motogadget提供，科幻的电子仪表则是Motoscope的出品，仪表的安装码是改装公司以铝合金经CNC制作而成的。把手、脚踏等都是LSL出品。卡钳改用瑞典的ISR，再配以Hel制动钢喉。四出二的排气造型十分独特，排气声亦十分迷人。
